La cuenca del río Grande de San Miguel cubre un área de 2,352.67 Km2 y colinda en el extremo norte con la cordillera de Cacahuatique-Corobán, con una altura máxima de 1,630 msnm (metros sobre el nivel del mar), sobresaliendo los cerros de La Campana, Borroñosa, Cacahuatique y Las Puntas.
Comprende, además, parte de los municipios de San Buenaventura, Jucuapa y Nueva Granada, del departamento de Usulután, y del municipio de El Carmen, del departamento de La Unión.
La Laguna de Aramuaca le acompañan leyendas que la abrigan de un especial y atractivo misterio. Un asentamiento indígena en sus profundidades y cantos de sirenas son parte de lo que los pobladores de los alrededores comentan de esta laguna.
Laguna Olomega es el mayor cuerpo de agua dulce de la zona oriental de El Salvador con una extensión de 24.2 kilómetros cuadrados y habitan en su interior las islas Olomega y Olomeguita, junto a otros islotes. Fue declarada Humedal de Importancia Internacional el 2 de febrero de 2010, por el Convenio de Ramsar.
Laguna de San Juan es un lago en Departamento de San Miguel, El Salvador. Laguna de San Juan está situada cerca de la localidad Los Sorto y de la aldea La Puerta.
Laguna El Jocotal es un área Natural Protegida, un humedal continental formado por dos lagunas permanentes de agua dulce, Laguna del Jocotal y Laguna de San Juan. El sitio es un reservorio de biodiversidad en el que se encuentran 151 especies vegetales
Al Norte colinda con la cordillera de Cacahuatique-Corobán, con una altura máxima de 1,630 msnm, sobresaliendo los cerros de La Campana, Borroñosa, Cacahuatique y Las Puntas.
Al Sur está limitada por una pequeña zona de la Bahía de Jiquilisco, que forma la desembocadura del río, en la zona de la bocana La Chepona, y con las colinas de Jucuarán.
Al Oeste con la cuenca del Río Lempa, pasando por los volcanes de San Miguel, Usulután, cerro El Tigre y Laguna Seca - El Pacayal
Al Este por la cuenca del Río Goascorán y los cerros Ventarrón, Yayantique, Juana Pacha y El Arco Comprende gran parte de los municipios del departamento de San Miguel, entre los que se encuentran los de San Miguel, Chirilagua, Quelepa, Moncagua, Chapeltique, Lolotique, Nueva Guadalupe y Chinameca.